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Para eliminar un elemento de un array hay que tener en cuenta que es diferente según el tipo de array, y según queramos eliminar un elemento por su clave o por su valor.

Eliminar por clave en array NO asociativo

$miArrayNoAsociativo[0]="A";
$miArrayNoAsociativo[1]="B";
$miArrayNoAsociativo[2]="C";

unset($miArrayNoAsociativo[0]);
//He eliminado "A", resultado (1=>"B",2=>"C");

unset($miArrayNoAsociativo[2]);
//He eliminado "C", resultado (1=>"B");

//Normalizar el array
$miArrayNoAsociativo = array_values($miArrayNoAsociativo);
//resultado (0=>"B");

Otra opción es utilizar array_splice directamente con cada elemento a eliminar, que provoca la eliminación inmediata de la posición del array y su normalización. Para eliminar los mismos elementos en este caso, hacemos:

$miArrayNoAsociativo[0]="A";
$miArrayNoAsociativo[1]="B";
$miArrayNoAsociativo[2]="C";

//Indicamos el array de dónde eliminar, la posición,
// y el 1 es para que sólo elimine esa posición
array_splice($miArrayNoAsociativo, 0, 1);
//resultado (0=>"B",1=>"C");

array_splice($miArrayNoAsociativo, 1, 1);
//resultado (0=>"B");

Eliminar por clave en array asociativo

Para este tipo de arrays, utilizamos unset:

$miArrayAsociativo["a"]="A";
$miArrayAsociativo["b"]="B";
$miArrayAsociativo["c"]="C";

unset($miArrayAsociativo["a"]);
//He eliminado "A", resultado ("b"=>"B","c"=>"C");

unset($miArrayAsociativo["c"]);
//He eliminado "C", resultado ("b"=>"B");

Eliminar por valor en array NO asociativo

$miArrayNoAsociativo[0]="A";
$miArrayNoAsociativo[1]="B";
$miArrayNoAsociativo[2]="C";

$posicionAEliminar = array_search("B",$miArrayNoAsociativo,false);
array_splice($miArrayNoAsociativo, $posicionAEliminar, 1);
//resultado (0=>"A",1=>"C");

Eliminar por valor en array asociativo

$miArrayAsociativo["a"]="A";
$miArrayAsociativo["b"]="B";
$miArrayAsociativo["c"]="C";

$posicionAEliminar = array_search("B",$miArrayAsociativo,false);
array_splice($miArrayAsociativo, $posicionAEliminar, 1);
//resultado ("a"=>"A","c"=>"C");